1. Les microorganismes dans lʼenvironnement tellurique (diversité de la microflore, facteurs influençant lʼabondance et la distribution des microorganismes; types trophiques). Rôle dans les cycles biogéochimiques : cycles du carbone (cellulolyse, amylolyse), de lʼazote (fixation, nitrification, ammonification...), du soufre, du fer. Biogéographie microbienne, Communication et symbiose; méthodes dʼanalyse de la diversité microbienne dans les écosystèmes : dénombrements directs et indirects, métagénomique.